Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm3443F7CCV5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm3443F7CCV5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm3443F7CCV5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm3443F7CCV5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm3443F7CCV5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm3443F7CCV5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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