Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm5624F6ZZG8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5624F6ZZG8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5624F6ZZG8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5624F6ZZG8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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