Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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