Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms