Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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