Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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