Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Plod2Q9R0B9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Plod2Q9R0B9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Plod2Q9R0B9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Plod2Q9R0B9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Plod2Q9R0B9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Plod2Q9R0B9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Plod2Q9R0B9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Plod2Q9R0B9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Plod2Q9R0B9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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