Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms