Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ap4m1Q9JKC7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ap4m1Q9JKC7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms