Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Tuba8Q9JJZ2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Tuba8Q9JJZ2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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