Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms