Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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