Protein–RNA interactions for Protein: Q9D180

Cfap57, Cilia- and flagella-associated protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap57Q9D180 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap57Q9D180 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms