Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Exo5Q9CXP9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Exo5Q9CXP9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Exo5Q9CXP9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Exo5Q9CXP9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Exo5Q9CXP9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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