Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms