Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Smg8Q8VE18 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Smg8Q8VE18 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Smg8Q8VE18 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Smg8Q8VE18 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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