Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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