Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Lrif1Q8CDD9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Lrif1Q8CDD9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Lrif1Q8CDD9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Lrif1Q8CDD9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Lrif1Q8CDD9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Lrif1Q8CDD9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms