Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms