Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms