Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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