Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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