Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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