Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms