Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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