Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Xirp2Q4U4S6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms