Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms