Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsponQ3UPR9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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