Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rnf180Q3U827 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rnf180Q3U827 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rnf180Q3U827 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rnf180Q3U827 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rnf180Q3U827 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rnf180Q3U827 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rnf180Q3U827 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Rnf180Q3U827 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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