Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms