Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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