Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CartptP56388 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CartptP56388 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CartptP56388 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CartptP56388 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CartptP56388 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CartptP56388 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CartptP56388 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CartptP56388 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CartptP56388 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CartptP56388 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CartptP56388 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CartptP56388 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CartptP56388 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CartptP56388 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CartptP56388 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CartptP56388 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CartptP56388 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms