Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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