Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FmodP50608 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FmodP50608 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FmodP50608 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
FmodP50608 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms