Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
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