Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms