Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms