Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TtrP07309 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms