Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Ab1P01921 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms