Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01787 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01787 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01787 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01787 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01787 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01787 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01787 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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