Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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