Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm10229-201ENSMUST00000089106 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Olfr462-202ENSMUST00000213672 2021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Mobp-201ENSMUST00000068698 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Atpaf1-202ENSMUST00000175725 996 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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