Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms