Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd1D3YXK1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd1D3YXK1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd1D3YXK1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd1D3YXK1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd1D3YXK1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd1D3YXK1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd1D3YXK1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd1D3YXK1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd1D3YXK1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd1D3YXK1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Samd1D3YXK1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms