Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms