Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms