Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Cldn22Q9D7U6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Cldn22Q9D7U6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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