Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrnp35Q9D384 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms