Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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