Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

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Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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